中药治疗口腔溃疡的疗效较为确切，比如云南白药等。云南白药是中国优秀的传统中药，含有多种活性成分，主要用于止血、活血化瘀、抗炎和愈伤等症。在口腔溃疡部位涂敷云南白药可以减轻疼痛，改善患处局部血液微循环，促进血管的生长及结缔组织增生，达到加快伤口愈合的作用。
维生素C片剂属酸性物质，涂于患处能够刺激腮腺活动，以分泌大量呈碱性的唾液来中和口腔环境。而唾液中含有的溶菌酶杀菌作用很强，且维生素C能增进羟化酶的活性，加快合成胶原蛋白和细胞间质，对溃疡面的保护很有作用，有利于口腔溃疡的治疗。
西咪替丁具有抗病毒、调节机体免疫功能的作用，还能止痛和促进溃疡愈合。
有报道冰硼膜中冰硼散（硼沙、冰片、朱砂、玄明粉）具有清热解毒、消肿止痛、生肌等功效。以壳聚糖为成膜辅料的冰硼膜具有良好的成膜性及与人体组织的相容性，冰硼膜贴于口腔黏膜的溃疡面上，有保护创面、杀菌、消炎、生肌、促使黏膜修复的作用，膜内药物集中在溃疡面上，缓慢释放，使局部保证有效的药物浓度，又消除了冰硼散使用不便及多数药物不能进入疮面发挥作用的缺点。
