第一，医院开出的药品，全部实行了零差率，试图改变以药养医局面和形成医药分开新业态。现阶段，中国绝大多数的医院在医疗服务中都是依靠药品加成来维持生存和发展的，而药品收入基本上要占据医院收入的40%-50%左右。医院的收支平衡也主要依靠药品加成，仅此项改变，就会让许多医院出现运营负数，这需要很大的改革勇气。
第二，医院增添医事服务费，体现了医生的医疗诊治的价值。过去一直被社会和医生诟病的医生看病5元钱挂号费和3元钱诊金，在此次北京医改，选择了直面此问题。在改革中去消了挂号费和诊金制，改变为医事服务费，并根据医院的级别和医师的级别加以不同的体现，比较好的扭转了医师诊治疾病的劳动和技术的价值问题，也逐步与国际惯例接轨。
第三，大型检查和大型设备收费有所下降。对于CT、PET-CT和核磁共振检查的费用，都有30%-50%的下降。对于医院过度依赖大型设备和不少医院存在的给病人过度检查的问题，都是一种扭转和控制的努力。这些大型设备在现行医院的医疗费用占也占有20%-30%，因此这一收费项目的调整，对于医院的影响比较大，对患者医疗费用也有明显减轻。
第四，医院体现医务人员技术劳务项目的收费有所增加，如手术费、护理费、治疗费和中医诊炙费用等，都有不同程度的提高。医院技术劳务收费畸形化，已经严重的影响了医务人员的工作积极性，而这项收费项目的增加，也充分体现了医务人员的劳动价值。
以上四点北京医改的变化是显著的，也是影响比较深远的，可以概括为两升两降：即增添医师服务费和增长医院技术劳务的收费标准，降低大型设备收费和取消药品加成收费等。另外，北京医改通过调整三级医院的医保支付标准和医疗收费标准，试图形成分级诊疗和患者“小病进社区”的就诊新格局，也是值得期待和研究。
