截至2016年6月底，全国医疗卫生机构数达98.9万个，其中：医院2.8万个，基层医疗卫生机构92.7万个，专业公共卫生机构3.1万个，其他机构0.3万个。与2015年6月底比较，全国医疗卫生机构增加3160个，其中：医院增加1804个，基层医疗卫生机构增加5698个，专业公共卫生机构减少4222个。
医院中：公立医院12958个，民营医院15303个。与2015年6月底比较，公立医院减少380个，民营医院增加2184个。
基层医疗卫生机构中：社区卫生服务中心（站）3.4 万个，乡镇卫生院3.7 万个，村卫生室64.3万个，诊所（医务室）19.9万个。与2015年6月底比较，诊所增加，社区卫生服务中心（站）、乡镇卫生院和村卫生室减少。
专业公共卫生机构中：疾病预防控制中心3484个，卫生监督所（中心）3173个。与2015年6月底比较，疾病预防控制中心减少5个，卫生监督所（中心）增加44个。
有关调查表明，我国民营医院的发展存在失衡的现象，主要表现为区域分布不均、城乡分布不均、城市分布不均。
第一，区域分布不均。
东部及沿海地区的民营医院在数量、规模、经营状况等方面都要好于中西部地区。造成这一现象的原因首先是东部及沿海地区的政府及相关部门对民营医院的重视程度更高，对推进新医改的力度相较于中西部地区也更大。其次东部及沿海地区的经济发展较好，具有丰富的社会资本去开设民营医院。而中部、西部地区在经济发展上有一定的差距，民营医院投入的资本相对较少，因此在规模和经营上落后于东部及沿海地区。
第二，城乡分布不均。
城市民营医院聚集度更高，乡镇民营医院除乡村私人诊所外，则仍以公立医院为主。这主要与城乡经济发展的差距有一定关系，经济发达才有足够的社会资本去兴办民营医院。此外，乡镇在对民营医院的扶持政策上远不如城市力度大，在一定程度上也不利于乡镇民营医院的发展。
第三，城市分布不均。
例如江苏、浙江、山西、福建等地城市的民营医院聚集度更高，广西、青海、宁夏等地城市的民营医院聚集度较低。相对于一个大中城市而言，民营医院的院址选择，既要和城市规划建设相联系，又要考虑到城市社区人口集聚相对集中的地段，以方便居民就医的需要，使民营医院能够更好地服务于城市社区居民。
